根據食管所處的生理位置及周圍組織的關系，將其分為三段，上段及頸段，從食管起始到胸廓的入口部位，中段及胸段，上接頸段，下至膈的食管裂孔，下段及腹段，為食管通過膈的食管裂孔至胃的賁門段，食管癌所在食管各段的位置不同，其治療方法及預后也不盡相同。
食管各段患癌的發病率不同，在這方面國內外學者做作的統計結果均相似，以發生在中段最多，約占半數，其次為下段，發生在上端者最少，中斷食管癌因其余主動脈弓血管分叉及靜脈期左心房毗鄰且緊密，癌組織侵襲這些重要器官，因此對于接受手術治療的中段食管癌手術切除率低于其他部位。
上段食管癌鄰近總血管及癌易侵襲這些部位，上段食管的手術切除率也較低，卻由于手術難度大，臨床上對上段食管癌的治療，多以放射治療首選。
由于下的食管癌較松動，卻與鄰近器官不緊密，所以下段食管的治療以手術為主切除率最高，預后也好，有人對3155例手術治療的食管癌和賁門癌患者做統計學分析，其結果是上段食管癌76例，手術切除率89.5%切除死亡率8.8%，食管中段癌1318例手術切除率94.5%，切除死亡率6.3%，下段食管癌798例，手術切除率98.5%，切除死亡率2%，賁門癌963例，手術切除率82.1%，切除出死亡率3.3%，從以上結果看出，血管各段的發病率有差異，造成食管癌發病部位不同的原因，正有待于進一步研究。
